Преобразование файла .nii в файл .stl

Я пытаюсь преобразовать файл .nii в файл .stl с помощью этого руководства.

Поскольку мой компьютер работает под управлением Windows, я запускаю FreeSurfer (Linux) в VirtualBox. Мне не удалось разрешить добавление гостей, поэтому я загрузил свой файл .nii по электронной почте. Я выполнил эту команду, чтобы извлечь данные из файла с помощью FreeSurfer: recon-all-s mybrain-all-i /home/fsuser/Desktop/brainscan.nii

К сожалению, это не сработало, и я получил следующее сообщение об ошибке:

"WARNING: tcsh v6.17.06 has an exit code bug! Please update tcsh!

ERROR: Flag -i/home/fsuser/Desktop/anat_stripped.nii unrecognized. -s mybrain -all -i/home/fsuser/Desktop/anat_stripped.nii Linux xubuntu-VirtualBox 3.2.0-23-generic #36-Ubuntu SMP Tue Apr 10 20:41:14 UTC 2012 i686 i686 i386 GNU/Linux

recon-all -s mybrain exited with ERRORS at Fri Jan 25 20:08:01 EST 2019

For more details, see the log file To report a problem, see http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/BugReporting"

Я думаю, проблема в том, что у меня нет приложения в VirtualBox, которое могло бы открыть файл .nii. Я попытался загрузить Mango, но когда я распаковал файл, там не было исполняемого файла. Что мне нужно сделать, чтобы мой файл .nii можно было преобразовать в файл .stl?

, 👍1

Обсуждение

Вы скачали Mango для Windows или linux?, @Lux Claridge

Вы установили третий инструмент, указанный в руководстве - "Преобразование DICOM в NIFTI" ?, @Carl Witthoft


1 ответ


2

Похоже, вы не включили пробел между флагом-i и файлом, хотя вы включили пробел в этот вопрос. Попробуйте выполнить команду, но включите пробелы между вашими флагами и каталогами файлов:

recon-all -s mybrain -all -i /home/fsuser/Desktop/brainscan.nii

,